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如何選擇合適的定量PCR儀
傳統(tǒng)的96孔板式定量PCR儀以美國(guó)應(yīng)用生物系統(tǒng)公司(ABI)為代表。傳統(tǒng)96孔板式定量PCR儀的優(yōu)點(diǎn)是可容納的樣本量大而且無(wú)需特殊耗材,可以采用傳統(tǒng)的96孔板甚至384孔板進(jìn)行批量的定量反應(yīng),但是缺點(diǎn)也顯而易見(jiàn)——溫度均一性不佳——平板固定加熱模塊的PCR溫度控制有邊緣效應(yīng)——樣品槽上每個(gè)孔之間的溫度存在差異——也就是所謂位置效應(yīng)(可參考生物通龍虎榜:PCR儀的選擇一文),因此標(biāo)準(zhǔn)曲線的反應(yīng)條件應(yīng)難以做到與樣本*一致,樣本和樣本之間的溫度控制也可能存在差異,對(duì)于靈敏度*的定量PCR來(lái)說(shuō),任何極微小的差異都會(huì)以指數(shù)級(jí)別的規(guī)模被放大,不能不說(shuō)是一種缺憾。傳統(tǒng)反應(yīng)板面積大,溫度控制的性、升降溫速度也相對(duì)較慢,因而反應(yīng)速度也較慢。96孔板定量PCR儀的熒光檢測(cè)分析系統(tǒng),由于96孔板上樣品孔的位置是固定的,每個(gè)樣品孔距離光源和監(jiān)測(cè)器的光程各不相同,有可能對(duì)結(jié)果產(chǎn)生影響。檢測(cè)在試管管底進(jìn)行,試管底的透光性和厚薄均一性都可能對(duì)結(jié)果產(chǎn)生影響。MJ和Bio-Red公司的定量PCR儀也屬于這一類(lèi)。